在Debian操作系统中利用GIMP实现文件格式转换的操作流程如下：

1. 安装GIMP软件： 若尚未安装GIMP，可借助Debian的软件包管理工具apt执行安装操作。于终端窗口内依次输入以下指令：

    sudo apt update
    sudo apt install gimp

2. 启动GIMP程序： 完成安装后，运行GIMP应用程序。

3. 加载文件： 转至菜单栏里的“文件”（File）选项，接着点击“打开”（Open），寻找目标文件并将其打开。

4. 输出文件： 返回菜单栏中的“文件”（File），选取“导出为…”（Export As…），挑选期望转换成的目标文件格式，同时设定保存路径与文件名称。

5. 应用插件或扩展功能： GIMP兼容各类插件及扩展模块，这些工具能够协助完成特定类型的格式转换任务。举例来说，若想把图像转存为PDF文档，可加装“PDF导出”（PDF Export）插件。

6. 确认保存改动： 在导出之前，请务必核查并保存所有已做的修改。

值得注意的是，实际操作过程中可能因所选文件格式以及GIMP版本差异而产生细微差别。